A sua logica morre na sua própria afirmação/suposição.
1- Se ele se achava inferior, porque lutaria contra um ninjas desses sem reforços?
2- E ele apenas ficou desse jeito porque Hanzo não só era um ninja poderoso, assim como ele tinha o poder daquele pais e consequentemente um homem rodeado de segurança de ninjas poderosos.
Em outras palavras, Jiraya se espantou pelo fato de Pain sozinho ter derrotado um homem poderoso e líder como Kim Jong Un de Naruto.