Kakashi falar que os Uchiha descendem dos Hyuga, pela historia da linhagem deles não é prova suficiente?
Eu particularmente acredito que estava nos planos do Kishimoto que o manga seguisse como seguiu, porem de um jeito menos kaguya. Isso inclui a origem do chakra, os primeiros usuários e o power sacalling nível god, tudo isso estava nos planos.