Eu não lembro de uma única entrevista onde ele já deixou a entender que guiou algum ponto da história por causa da popularidade ou da falta de popularidade de algum personagem. A própria Sakura, mesmo o Kishimoto afirmando que ela não era tão popular quanto outros personagens e era odiada pelas garotas, mesmo sendo a heroína, ele nunca deixou de fazer ela uma presença constante na história ou a substituiu.
O proprio Kishimoto falou que não criou um arco próprio da Sakura ou que não introduziu os pais dela na Obra
Justamente por ele achar que ela não era popular o bastante na época.
Não sei de onde você tirou isso, o inicio do Shippuden é um dos picos de vendas da obra.
Claro que Naruto sendo uma série consolidada. Nunca teve uma queda de vendas tão abrupta como Boruto.
Mas existem outros indicadores de popularidade como engajamentos dos fans, ratings e etc.
Novamente use o Google. É fato mundialmente conhecido pelo fandom que o arco dos Imortais foi corrido e apressado para o proximo arco com o Sasuke vim o mais rapido possivel.
Inclusive Kishimoto falou em uma entrevista que tinha planos de Hidan e Kakuzu terem muito mais habilidades. Mas não teve tempo de introduzir isso pelo arco ter sido encurtado.
Deidara e Sasori só foram reaparecer anos depois do concurso de popularidade em que eles apareceram no top 10, coisa de 6 anos depois. Não faz sentido nenhum pensa que isso foi por causa da popularidade, mesmo que eles continuassem sendo tão populares quanto na época, Kakuzu também foi revivido, Asuma foi revivido e teve mais destaque que os dois, Hanzou foi revivido e teve mais destaque os dois.
Kishimoto obviamente levava a popularidade dos personagens em conta, eu duvido muito que Gaara continuaria tendo a presença que teve se não tivesse se tornado popular, mas ele claramente não guiava a história com base nisso, se fosse esse o caso: Neji, Gaara e Shikamaru seriam personagens recorrentes, Iruka seria um protagonista, Deidara teria recebido seu próprio arco.
Mas do que diabos você esta falando? Obviamente apenas os personagens principais podem ter arcos.
O único personagem fora da curva que recebeu um arco para ele foi apenas Shikamaru.
Deidara e Sasori ja tinham tido seus respectivos arcos de vilões principais antes da sua morte. Eles receberam o primeiro arco do Shippuden. Onde Deidara captura Gaara e luta com o Kakashi e Naruto.
Sasori luta com Sakura e Chiyoo e posteriomente Deidara luta com Sasuke.
O Edo Tensei foi apenas fanservice mal feito do Kishimoto. Todos os Edo Tensei foram mal aproveitados. Com excessão de Itachi que estava relacionado ao Arco do Sasuke. Madara e Obito eram os vilões principais da Guerra. Não fazia sentido Deidara e Sasori serem os "principais' nesse ponto da historia. Edo Tensei foi apenas um fanservice fraco para os fans verem eles em ação outra vez.
Errado. Naruto teve outra pesquisa de popularidade em 2012. E Deidara e Sasori foram os únicos Akatsukis a aparecerem no TOP 10 junto com o Itachi.
Novamente, de onde você tirou essa informação? Neji e Gaara estiveram no top 10 de basicamente todos os rankings de popularidade que participaram após serem devidamente introduzidos.
Estou falando que a popularidade de Neji e Gaara jamais se comparou a Sasuke, Naruto, Kakashi ou mesmo Itachi em qualquer época.
Nessa ultima pesquisa os dois não ficaram nem no TOP 10.
Além do mais Neji foi usado como um sacrificio para a Hinata. Kishimoto falou que apenas matou Neji para fazer um momento para Hinata se aproximar do Naruto.
Sasuke é o personagem mais popular da franquia e foi "morto" em Boruto.
Sakura é a personagem viva mais popular segundo a ultima pesquisa.
Sasuke não foi "morto" Ele perdeu o Rinnegan e foi selado até o fim do manga. Assim como Naruto perdeu a Kyuubi e também foi selado.
Outros personagens populares como Sakura e Kakashi também sumiram.
Gaara e todo resto idem.
Talvez isso explique perfeitamente porque Boruto é tão impopular e perdeu tantas vendas, além da historia e artes ruims.
Ninguém vai ler e muito menos comprar uma sequencia que trata seus personagens favoritos do manga original como lixo ou fingem que eles não existem.