Primeiro de tudo, a invisibilidade do Muu seria inútil se ele estiver dentro do raio de alcance da Kekkai, mas considerando que ele é sensitivo dos poderosos e muito inteligente ele poderia não cair nesse truque ( No caso do Pein, ele não caiu DEVIDO O CONHECIMENTO ).
No entanto, a questão não é essa, pois o Muu tendo ciência disso, teria que MANTER DISTÂNCIA pra não ser detectado da mesma maneira que fez o Chikushodou, e além de manter uma distância BEM relevante, ele teria que apelar pro longo alcance, e os projéteis em forma de cone ou cilindro lançados a uma distância muito grande, dariam CHANCES ENORMES para o Sannin escapar devido as suas habilidades evasivas e agilidade aliadas a outras armas, principalmente pelo fato dele ter ciência de tudo o que "penetra" e se move dentro da sua barreira.
Agora, se o Muu decidir recorrer ao médio alcance como fez contra o Gaara e Onoki, além disso tbm não ser muito relevante já que ele não poderia utilizar do fator surpresa para surpreender o Jiraiya pela retaguarda, isso tbm abriria brechas para o contra-ataque do Sannin que é muito bom nesse quesito, e poderia aproveitar da brecha que o Jinton abre enquanto o Usuário está parado e focado para realizar a técnica, e "castar" o Jutsu ou até mesmo acertar o Muu igual o Naruto fez.
E o alcance da barreira é MUITO GRANDE e ela se move junto com Jiraiya, vejam na imagem a seguir:
Viram? O Ken por sí só é GIGANTESCO, mas, é minusculo dentro do raio de alcance da barreira, e Jiraiya e Muu ficando nesse pega-pega, acabaria sendo vantajoso para o Sannin que ganharia tempo para ativar o SM, e ativando sua técnica suprema e tendo o suporte dos sapos anciões, Jiraiya ganha vantagens muito boas nessa comparação.
Lembrando que, Muu é indetectável contra meios sensoriais que usam o Chackra do alvo para ser detectá-lo ( Sharingan, habilidades sensitivas e etcetera ), mas através de meios físicos ou de rastreamento que usam o FARO, ele não é indetectável, pois ele NÃO É INTANGÍVEL e nem apaga seu cheiro.
A língua da Maa tbm poderia localizá-lo, e além dela ser MUITO RÁPIDA e poder entrelaçar no Tsuchikage, dependendo da distância, ainda emiti aquele líquido corrosivo que obrigaria o Muu a sair do "modo invisivel" e iria deixá-lo atordoado.
Logo, a invisibilidade, não é vantagem nessa comparação, devidos os meios que o Sannin dispoe.
Na questão dele voar, é uma vantagem boa contra Ninjas do tipo CURTO ALCANCE, porque Jiraiya é extremamente versado no médio~~longo alcance, vimos quando ele subjulgou a Konan mesmo voando, e Jiraiya possui técnicas que poderiam pegá-lo e neutralizá-lo, com Jutsus igual o Ranji Shigami no Jutsu.
Se o Muu ir pro Taijutsu, ele morreria devido a enorme força física e agilidade do Sannin no Modo Sennin.
Ambos teriam dificuldades para acertar um ao outro no Ninjutsu, mas nesse quesito, Jiraiya se mostrou mais capaz, pois além de ser astuto, ele tem uma variedade e versatilidade enorme no médio~~longo, e por mais que o Muu seje sensitivo, o Jiraiya SM é mais rápido do que ele e pode driblar a capacidade sensitiva do Muu com o Senpou: Kawazu Naki ou o Senpou: Sunabukori, ou então fazendo um bom uso de Bunshins ( O que seria uma boa vantagem nessa luta em especifico ), sapos e jutsus elementais, igual fez na luta contra o Pein, ele poderia surpreender o Muu nessa situação, e assim poderia acertá-lo com o Senpou Kebari Senpou, por exemplo ( Lembrando que, esse é o Jutsu mais rápido do Jiraiya e abrange uma área muito grande, e só com um escudo para se defender desse ataque por ele ser contínuo ).
E se acertado por essa técnica, o Muu poderia se dividir para não sofrer danos relevantes, mas daí não poderia se juntar a sua "outra metade" que teria virado uma almofada de agulhas, literalmente, e com isso, Muu perderia muito, pois já vimos que o poder dele se dividi igualmente com esse clone, e isso até mesmo o impossibilitaria de usar o Jinton.
E se o Sannin quiser ser mais mortal, atingí-lo com um Chou Odama Rasengan, que o Tsuchikage não teria resposta alguma.
Outra boa opção do Jiraiya em SM, seria o Gamarinshou, já que por ser um Gen que age através do som de quem o ouve, o Muu não teria como escapar ou se defender dessa técnica, apenas poderia evitá-la impedindo sua conclusão, o que seria imporvável, já que ele não tem conhecimento.
Com tudo isso, vejo Jiraiya vencendo.