Vocês estão fazendo confusão.
Madara em momento algum mostrou velocidade nível juubito, muito menos a de um teleporte.
Lembrem-se que o Tobirama estava se locomovendo através de uma kunai marcada, e após ele se teleportar por meio dela, Madara conseguia sentir a presença dele no mesmo instante através do sensor.
O hiraishin é instantâneo, mas o movimento que você executa DEPOIS do teleporte, não.
Tobirama estava se teleportando através de uma ferramenta que depois ele tinha que usar para o ataque, abrindo assim uma pequena brecha que poderia ser explorada naquele momento.
É algo totalmente diferente do ataque usado num alvo marcado, já que os hokages se teleportam exatamente em cima dele, acertando o ataque no mesmo instante, não abrindo nenhuma brecha e não dando qualquer tempo de reação por parte do adversário, vide o juubito.
São situações diferentes.
O Killer Bee conseguiu impedir o Raikage de ser stunado pelo ataque do Minato usado através do hiraishin nível 2, vimos que usando um de seus tentáculos, ele bloqueou o Minato enquanto ele estava prestes a "pousar" em cima do A depois de se teleportar para uma kunai deixada próxima a ele.
O Madara conseguiu explorar essa brecha, sentindo a presença do Tobirama no momento em que ele se teleportou em cima dele, e usando seus jutsus gravitacionais, Madara imobilizou o Tobirama antes de ser atingido DA MESMA FORMA que fez com o Sasuke.
E com isso, ele conseguiu fincar várias estacas no corpo do Tobirama, o paralisando.
Se o Madara estivesse marcado, ele seria atingido, assim como o juubito também foi.