Explodi-lo agora seria quase que impossível.
Agora que ele virou Jin do Juubi, Madara tem o Onmyouton, que lhe oferece uma defesa absoluta sobre qualquer ataque. Explosões não sejam nada pra uma defesa de Onmyouton.
Então o único meio atual é selar o Deus Uchiha. E visto o ultimo manga pode-se dizer que ele será selado na Benihisago.