Naruto
Como já mencionaram, Naruto poderia ser treinado por Minato, Kushina, Kakashi, Jiraiya e, quem sabe, até a Rin (não morreria sob essas condições estabelecidas pelo tópico). Então, acredito que ele seria bem forte.
- Rasengan + variações (pai)
- Kuchiyose: sapos ou cães [ou ambos] (pai, Jiraiya, Kakashi)
- Fuuinjutsu (mãe)
- Hiraishin (Naruto seria melhor instruído desde a infância, então não seria um espanto se ele aprendesse essa técnica do mesmo jeito que aprendeu o Rasenshuriken)
- Modo Sennin (pai, Jiraiya)
E ainda poderia ter conhecimento geral em Ninjutsu/Taijutsu/Genjutsu por causa do Kakashi mais presente, e até Ninjutsu Médico, com a Rin. Não que ele saberia usar essas habilidades, mas poderia entender como elas funcionam (tipo, o Jiraiya não é bom em Genjutsu, mas sabe como eles funcionam). Bom, isso é com bastante hype, tem que levar em consideração a personalidade que ele teria também, mas de uma maneira geral, tudo isso estaria sob seu alcance. E desde que a Kushina era amiga da mãe do Sasuke, ele poderia aprender um pouco com os Uchiha também. Poderia até não ser tão forte quanto o original, mas certamente continuaria bem poderoso.
Sasuke
Esse é mais complicado. Não dá pra assumir que Itachi e Sasuke despertariam o Mangekyou Sharingan sob essas condições, pois isso só aconteceu por causa do ataque da Kyuubi e tudo mais, então eles ficariam bem nerfados. Seriam fortes, é claro, poderiam até chegar ao nível Kage dos mais fracos, mas dificilmente passariam muito desse nível. Mas caso despertassem, ambos poderiam obter o EMS, trocando os olhos simultaneamente, um pelo outro, aí os dois teriam Tengu e seriam mais apelões que o Madara. Porém, a possibilidade disso acontecer também é bem baixa. Não vejo algum gatilho que os faça despertar o MS, os perigos restantes não parecem ser muito problemáticos... seria Orochimaru (mal derrotou o Hiruzen, dificilmente derrotaria o Minato), Danzou poderia causar uma confusão aqui e ali, mas quem sabe Hiruzen tomasse vergonha na cara e parasse ele, ou o Minato fizesse isso, fora isso, só restaria Zetsu arranjando um jeito de manipular o Nagato, e mesmo ele talvez não conseguisse dar conta de derrotar uma Konoha mais forte que a original, por causa de Minato, Uchihas, Jiraiya, Hiruzen, etc.
Considerando uma situação mais provável, Sasuke estaria limitado a:
- Sharingan
- Katon de alto nível
- Shurikenjutsu de alto nível
- Genjutsu
Ou seja, um Uchiha padrão com habilidades elevadas ao limite. Com sorte, ele seria treinado pelo Kakashi e poderia conseguir usar os 5 elementos e tals, mesmo assim, não acho que seria tão forte quanto o original. A não ser que o Zetsu manipulasse ele como fez com as demais reencarnações do Indra, mas aí já é algo mais complicado.