"Eu subestimei ele. Itachi Uchiha é claramente
diferente!. Ele resistiu ao Edo Tensei."
De fato,
analisando por fora do contexto, o Kabuto quis dizer exatamente isso: Itachi era mais poderoso do que os demais. Casos similares aconteceram para com Hashirama, Madara e Tobirama, por exemplo. Casos ligeiramente mais sutis aconteceram para com Hanzou e Sasori.
Porém, como já explicado,
trazendo essa frase para o contexto, isso reflete apenas a inteligência do Itachi, planos reservas, etc. Similar a Minato e Shikamaru. Em questões de 'poder de luta', o máximo que o mangá chegou a sugerir em relação aos níveis desses quatro aí foi o seguinte:
http://unionleitor.top/leitor/mangas/Naruto/549/01.png
"Quatro ninjas classe A se enfrentam"
Ou seja, baseado nisso, seria possível dizer que entre esses quatro, poderia não existir um abismo entre cada um deles, o que corrobora com o rumo que a luta estava levando... Itachi estava tão equilibrado com o Killer Bee quanto Naruto para com Nagato. As coisas só mudaram depois do Uzumaki ruivo se tornar 'completo'.