Que Naruto se encontrará com Rikudou, não podemos afirmar com certeza, mas digamos que esse fato é o mais provável á acontecer. É provável que, Rikudou antes de morrer possa ter, digamos que passado a ser parte das bijuus, ou mais especificadamente pode ter depositado tudo de si em cada bijuu... existem grandes provas disso... Observem que quando Madara e Obito se tornam jinchurikis do Juuubi, ambos adquirem á aparência de Rikudou, junto com suas armas lendárias, Está ai uma grande prova de que Rikudou está presente nas Bijuus. Também vamos considerar outro fato.... Naruto assim que entra no seu modo Bijuu 1 e 2, ou mais detalhadamente no modo Bijuu incompleto e completo, ele adquire a aparência de Rikudou. No caso de seu modo Bijuu incompleto ele adquire algo semelhante a chifres no cabelo e adquire aqueles símbolos do Rikudou que são semelhantes aqueles pontos que tem no Sharingan. Já no modo Bijuu completo quando Naruto funde seu chakra com o da Kurama, ele fica muito semelhante ao Rikudou, no caso ele adquire uma capa de chakra e muitas características de Rikudou.
Então acredito que Rikudou se faz presente nas bijuus. Antes de Rikudou morrer, ele deve ter dividido todo seu poder, ou tudo que há em si, mais especificadamente Rikudou se funde com cada bijuu, ou seja sua essência passa a ser a essência das bijuus assim se tornando algo como uma entidade.
Talvez Rikudou tenha feito isso como parte da profecia, para que algum dia quando as Bijuus matassem todas as suas energias malignas e encontrassem o verdadeiro poder, elas se tornassem uma entidade novamente, mas com um nome diferente.
Ou seja, graças ao Chakra das Bijuus que está depositado nele, Naruto terá acesso ao lugar interior onde as Bijuus estão, e eles terão uma longa conversa, sobre muitas coisas e enfim como parte da profecia, elas ( as Bijuus) se fundiram, se tornando o próprio Rikudou em si, ou mais especificadamente, talvez fundam a essência de Rikudou depositada em cada uma, e assim fazendo o Rikudou surgir. Assim que Rikudou surgir ele e Naruto terão uma conversa, falando sobre o próprio Rikudou, falando sobre muitas coisas, e enfim chega a hora Naruto e Rikudou se fundem assim passando a ser uma entidade, assim nasce o novo Rikudou, conhecido como "Uzumaki Naruto".
Bom galera essa é minha teoria, que no caso é baseada em fatos do mangá.