Eu não acho que os Hyuugas casavam apenas entre eles, até porque em The last ao que tudo indica o Hamura teria uma filha(a princesa Byakugan) e ela ficou na terra e deu origem aos Hyuugas, sendo assim ela casou com um homem normal e com isso o Clã Hyuuga teve inicio, nunca vi ser dito no Manga que os Hyuugas praticavam casamento entre eles para manter a linhagem pura, pelo contrario o proprio Hiashi não foi contra a hinata casar com alguém fora do Clã mesmo que ela seja uma das Hyuugas mais "puras" da atualidade(a mais proxima do Hamura, já que foi a unica que herdou seus poderes nessa geração).
Creio que a genética do Minato(olhos azuis e cabelos loiros) sejam predominantes demais, vide que a característica marcante dos Uzumakis(cabelos vermelhos) foi substituída pelo loiro do Minato, e o Byakugan da Hinata foi substituído pelos olhos azuis do Naruto, mas no caso mesmo essa característica física sendo marcante isso não inibi a genética materna nessa historia, assim como Naruto nasceu com chakra poderoso por parte de sua mãe mesmo não tendo características delas, Bolt e Hima nasceram com a capacidade de despertar o Byakugan como a mãe.
Creio que a genética do Minato(olhos azuis e cabelos loiros) sejam predominantes demais, vide que a característica marcante dos Uzumakis(cabelos vermelhos) foi substituída pelo loiro do Minato, e o Byakugan da Hinata foi substituído pelos olhos azuis do Naruto, mas no caso mesmo essa característica física sendo marcante isso não inibi a genética materna nessa historia, assim como Naruto nasceu com chakra poderoso por parte de sua mãe mesmo não tendo características delas, Bolt e Hima nasceram com a capacidade de despertar o Byakugan como a mãe.