Pelo que entendi, Obito só se mantém vivo por conta do Gedo Mazo, que é como se fosse uma casca protetora. Vou explicar melhor.
Os bijuus, sem um jinchuuriki, até onde foi mostrado até agora, possuem apenas uma existência física temporária, já que a forma original deles é estarem juntos como Juubi/Shinju, que seria seu verdadeiro corpo físico. Sem um corpo unificado ou sem o Gedo ou Jinchuuriki, eles são apenas um conglomerado de chakra que adquire a forma de uma besta.
O Gedo Mazo era a forma de aprisionar e armazenar essa chakra, da mesma forma que o Jinchuuriki serve de recipiente e ao mesmo tempo de corpo.
Para efeito de comparação e para entendermos porque Obito não morreu, eu acredito que seu corpo agora tem propriedades semelhantes ao Gedo Mazo, ou seja, seu corpo físico atual é semelhante ao Gedo e mantem sua alma ali armazenada/"viva" (daí ele não ter morrido após a extração dos bijuus. Por ter sido Jinchuuriki do Juubi, sua pele, carne e etc, o corpo físico, se tornou ou é o próprio Gedo). Lembremos que a partir do momento em que se torna um Jinchuuriki, a alma do shinobi fica ligada a da bijuu. Portanto, extraiu bijuu, extraiu alma do shinobi (daí ocorrer a morte).
Se essa "casca" for danificada (já está extremamente enfraquecida, ao ponto dele ficar praticamente paralisado), ele morrerá, a alma será "liberada" do corpo.
Contudo, com a "troca" que Madara fez, não sei como essa situação ficará.