Bom, vim fazer minha análise.
Essa batalha tem dois dos maiores gênios em batalha do mangá. Itachi rapidamente descobre o ponto fraco de qualquer técnica, enquanto Minato rapidamente analisa como funciona a técnica do adversário.
Sobre conhecimento... Minato vai ter conhecimento do sharingan, mas não sabe do mangekyou sharingan nem que o Itachi é especializado em genjutsu. Itachi terá conhecimento que Minato é o ninja mais veloz do mundo, o deixando atento e precavido desde o começo da batalha. Itachi também deve imaginar que Minato use, ou uma técnica que use seu corpo muito veloz ou que use espaço/ tempo. Provavelmente Itachi também sabe que Minato usa o rasengan.
O sharingan do Itachi pode ajudar ele contra ataques que não utilizem o hiraishin.
O Amaterasu do Itachi pode ser evitado pelo hiraishin.
Tsukuyomi é uma boa arma, e se o Minato for atacar o Itachi da mesma forma que ele atacou Tobi, tem boas chances de cair no genjutsu.
Bunshins deverão ser usados por Itachi no começo da batalha.
Minato com sua alta velocidade e reflexo dificultará muito o taijutsu do Itachi, mesmo com sharingan ativado.
O hiraishin do Minato pode servir como ataque surpresa contra Itachi, que se marcar Itachi, e não for um bunshin, já era pro Itachi. Se conseguir aparecer em cima ou atrás dele com hiraishin, ainda não deve matar o Itachi já que a ativação do susano'o é instantanea.
Rasengan do Minato é muito útil e se acertar o Itachi vai deixar ele bem quebrado.
Kuchiyoses não chegam a ser úteis contra o Itachi que possui Amaterasu.
No geral, ambos são muito poderosos e devem ficar muito atentos para as primeiras investidas um do outro. Creio que seria uma batalha que não acabaria rápido, mas não demoraria para terminar também.
Analisando uma batalha dessas, eu diria que o Itachi possui uma leve vantagem, principalmente pelo Minato não ter conhecimento dos genjutsus mais perigosos do Itachi.
Itachi 6/10
Itachi mal vence usando o Mangekyou, sem o Sharingan Itachi é humilhado.